Die Spezielle Botanik beschäftigt sich mit der Vielfalt der Pflanzen, ihrer Verteilung und ihrer Entstehung. Um gesicherte Aussagen über evolutive Veränderungen treffen zu können, nutzen wir alle Merkmalsbereiche der Pflanzen, die wir mit klassischen und modernen Methoden untersuchen.
In Jena, mit seiner langen Tradition wissenschaftlicher Botanik, liegt es nahe, sich auch mit der Geschichte des Faches zu befassen.
Der Versuch, die natürliche Ordnung im Pflanzenreich zu finden, zieht sich seit mehr als zweihundert Jahren wie ein roter Faden durch die botanische Forschung in Jena. Heute nutzen wir alle Merkmalsbereiche der Pflanzen, um zu einem stabilen System zu kommen und gesicherte Aussagen über evolutive Veränderungen im Lauf der Erdgeschichte zu treffen. Für die Klärung taxonomischer und phylogenetischer Fragen stellt die Aufklärung der Entstehung von Artengruppen mit komplizierten Fortpflanzungsverhältnissen eine besondere Herausforderung dar. In Jena fokussieren wir uns auf die Evolution von Hybridkomplexen am Beispiel der Gattungen Baccharis und Festuca sowie auf die Phylogenese der Subtribus Centaureinae (Asteraceae, Cardueae).
Jena verfügt über eine der weltweit bedeutendsten Sammlungen von Moosen. Auf dieser Grundlage untersuchen wir die Lebermoosordnung der Porellales (Hepaticae) molekularsystematisch und morphologisch.